CMK'nın 250. maddesinde yapılan değişiklikle ilgili Adalet Bakanlığı tarafından hazırlanan 'Bilgi notu'nda sivil yargı ile askeri yargı arasındaki farklara işaret edildi. Bilgi notunda askeri yargının alanının genişlediğine vurgu yapılırken, askeri suçlarda soruşturma açmanın izninin komutana ait olduğu belirtildi. 'Bilgi Notu'nda sivil yargı ile askeri yargı arasındaki farklar şöyle sıralandı:
SUÇ İHBARI ASKERİ MAKAMA: "Adli yargıda suçların ihbar veya şikayeti hiçbir formaliteye bağlanmamıştır. Kural olarak suçların ihbar veya şikayeti cumhuriyet başsavcılığına veya kolluk makamlarına yapılmaktadır. Oysa askeri suçlara ilişkin ihbar ve şikayetlerin doğrudan askeri savcıya yapılması mümkün değildir. Bunların askeri makama yapılması gerekir."
KOMUTAN İZNİNE BAĞLI: "Araştırma ve kovuşturma görevi bir suç haberinin savcıya ulaşması ile birlikte başlar. Oysa bir suçun işlendiğini öğrenen askeri savcının ağır ceza mahkemesinin görevine giren suçlar veya gecikmesinde sakınca bulunan haller dışında kendiliğinden soruşturma yetkisi bulunmamaktadır. Uygulamada askeri savcılar ağır askeri birlik komutanı veya askeri kurum amirinin emri olmaksızın harekete geçememektedir."
TUTUKLAMA YETKİSİ VAR: "Adli yargıda suç işleyen kişinin tutuklanmak üzere sevk yetkisi cumhuriyet savcısına aittir. Oysa askeri yargıda, askeri savcıdan ayrı olarak askeri kıt'a komutanı veya askeri kurumunun amirinin de tutuklanma talebinde bulunabilme yetkisi bulunmaktadır." (Yeni Şafak)
