Başsavcılık, 'Kayıp Trilyon' davasında Gül hakkında verilen 'takipsizlik' kararını kaldıran Sincan 1. Ağır Ceza Mahkemesi'nin kararının "kanun yararına bozulması'' istemiyle Adalet Bakanlığı'na başvurdu. Cumhuriyet Savcısı Kürşat Kayral tarafından yapılan başvuruda, şikâyetçi Cahit Nalbantoğlu'nun, yaptığı itirazın geçerli olmadığı kaydedildi.
Nalbantoğlu'nun yasal itiraz süresi dolduktan 28 gün sonra dilekçe verdiği ortaya çıkmıştı. Başsavcılığın başvurusunda, Sincan 1. Ağır Ceza Mahkemesi'nin kararında, anayasal boşluk olduğunun kabul edildiği halde "takipsizlik'' kararının kaldırıldığı, dolayısıyla bu kararın usul ve yasaya aykırı olduğu belirtildi.
Adalet Bakanlığı, istemi yerinde görürse Sincan Mahkemesi'nin kararını, ''kanun yararına bozulması'' talebiyle Yargıtay'a götürecek. Süreçle ilgili kararı Yargıtay verecek. Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı, "Kayıp Trilyon'' davasıyla ilgili olarak, Cumhurbaşkanı Gül hakkında, "mevcut anayasal sistem gereğince, iddia olunan eylemlerin kanıt ve unsurları tartışılmaksızın, yasal imkansızlık nedeniyle soruşturma yapılmasına gerek olmadığına'' karar vermişti.
Kararda, "Cumhurbaşkanının, seçilmeden önce işlemiş olduğu kişisel suçlarından dolayı Anayasa'da bir hüküm yer almadığı gibi TBMM İç Tüzüğü'nde de bir düzenlemenin mevcut olmadığı, demokratik rejimlerde devlet başkanının dokunulmazlığının kabul gören bir imtiyaz şeklinde oluştuğu'' kaydedilmişti. Ancak Sincan 1. Ağır Ceza Mahkemesi, Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı'nın, "kovuşturma yapılmasına yer olmadığına'' ilişkin kararını itiraz üzerine kaldırdı. Gül, hakkında 'şüpheli' kavramının kullanıldığı kararda, Anayasa'da boşluk olduğu iddia edildi, bunun kıyas yolu ile değil, hukuki düzenleme ile ortadan kaldırılması gerektiği dile getirildi. Başsavcılığın kararının hukuka aykırı olduğu savunuldu. Kararı veren hakim Osman Kaçmaz'ın Ergenekon sanığı Kemal Kerinçsiz'le olan ilişkisi tartışma konusu olmuştu.
