İddianamede Ergenekon'un terör örgütü olarak nitelenmesi ve Danıştay saldırısının azmettirme sonucu gerçekleştiğine ilişkin ifadelere dikkat çeken Altan, Danıştay saldırısına bakan mahkemenin iddiaları tam olarak araştırmadan karar verdiğini söyledi. Altan şöyle konuştu: "Karar, AK Parti'nin kapatılma sürecine geldi. Kimse de bunun çok fazla üstünde durmadı. Ama bu konunun tekrardan gündeme gelmesinin vesilesi olabilir. Çünkü Danıştay baskını ile ilgili inanılmaz iddialar ortaya atıldı. Şimdi Ergenekon, bu iddiaları kanıtladığını söyleyen bir süreci başlatıyor. Adalet Bakanlığı'nın emriyle o dosya yeniden açılabilir diye tahmin ediyorum." Altan, Danıştay saldırısına bakan mahkemenin Ergenekon davasını beklemeden ve iddiaları araştırmadan karar vermesinin de akıl karıştırıcı olduğunu ifade etti.
