Ümraniye'deki gecekondu baskınıyla start aldı...
1. Dalga: Ergenekon operasyonu 12 Haziran 2007'de bir ihbarla başladı. İstanbul Ümraniye'de bir gecekondunun çatısında 27 adet el bombası yakalandı ve bombaların Cumhuriyet Gazetesi'ne atılan bombalarla aynı seriden olduğu tespit edildi. Emekli Astsubay Oktay Yıldırım ve Muzaffer Tekin'in aralarında bulunduğu eski asker yedi kişi tutuklandı. Sanıkların evlerinde ise 'Ergenekon' ve 'Lobi' isimli belgeler ele geçirildi.
2 Dalga: Savcı Öz'ün soruşturmayı genişletmesi sonucunda ikinci dalga operasyonu 1 ay sonra geldi. Yazar Ergun Poyraz, Akın Birdal'a yönelik suikast sırasında ismi gündeme gelen ve 'Yeşil' kod adlı Mahmut Yıldırım'ın adamı olarak bilinen Mete Yalazangil tutuklandı.
3 Dalga: Operasyonun üçüncü dalgası 21 Ocak 2008'de gerçekleşti. Aralarında emekli Tuğgeneral Veli Küçük, emekli Kurmay Albay M. Fikri Karadağ, avukat Kemal Kerinçsiz, gazeteci Gülay Kömürcü, Susurluk hükümlüsü Sami Hoştan, 'Drêj Ali' olarak tanınan Ali Yasak ve Türk Ortodoks Patrikhanesi Basın Sözcüsü Sevgi Erenerol'un da aralarında bulunduğu 31 kişi gözaltına alındı. Küçük'ün evinde Milli Güvenlik Siyaset Belgesi, Ergenekon ve Lobi adı verilen yapılanmalara dair dokümanlar bulundu.
4. Dalga: Operasyonun dördüncü dalgası 21 Şubat 2008'de geldi. İstanbul Üniversitesi Adli Tıp Enstitüsü'nde görevli Doç. Dr. Ümit Sayın, Sakarya Üniversitesi öğretim görevlisi Prof. Dr. Emin Gürses, emekli astsubay Orhan Tunç, Özal ailesinin kuyumcusu olarak ün yapan kuyumcusu Hayrettin Ertekin, gazeteci Vedat Yenerer, Nœl Baba Barış Konseyi Derneği Başkanı Muammer Karabulut gözaltına alındı ve 25 Şubat'ta tarihinde tutuklandı. Ertekin'in evinden Glock marka silah bulundu.
5 Dalga: Operasyonunun beşinci dalgasında Doğu Perinçek, eski İstanbul Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Kemal Alemdaroğlu ve Cumhuriyet gazetesi yazarı İlhan Selçuk'un da aralarında bulunduğu 13 kişi gözaltına alındı.
...Darbe planları yapan paşalarla devam etti
6. Dalga: Bu dalganın hemen ardından Ankara Ticaret Odası(ATO) Başkanı Sinan Aygün, Atatürkçü Düşünce Derneği(ADD) Genel Başkanı ve emekli Orgeneral Şener Eruygur, emekli Orgeneral Hurşit Tolon ile Cumhuriyet Gazetesi Ankara Temsilcisi Mustafa Balbay gözaltına alındı. Balbay, serbest bırakıldıktan bir süre sonra bilgisayarında çıkan belgeler üzerine tutuklandı.
7. Dalga: Ergenekon'un 7. dalgası tüm Türkiye'ye yayıldı. İstanbul Cumhuriyet Savcılığı'nın talebi üzerine Adana'da bulunan özel yetkili 8. Ağır Ceza Mahkemesi, 26 kişi hakkında yakalama emri çıkarttı. Kararın ardından Konya'da 13, İstanbul'da 5, Kocaeli'nde 6, Elazığ ve Mersin'de birer kişi gözaltına alındı.
8. Dalga: Bu dalga askerlerin gözaltına alınmasıyla gündeme geldi. Beş ilde eşzamanlı gerçekleşen operasyonlarda orduda görevli 15 subay gözaltına alındı.Ayrıca 'Sisi' lakaplı Seyhan Soylu ve Nurseli İdiz de gözaltına alınanlar arasındaydı.
9 Dalga: Bu dalgada ise Tuncay Özkan, Esenyurt eski Belediye Başkanı Gürbüz Çapan ve eski Organize Suçlar Şube Müdürü Adil Serdar Saçan tutuklandı.
10 Dalga: Soruşturmanın 10. dalgasında Milli Güvenlik Kurulu (MGK) eski Genel Sekreteri emekli Orgeneral Tuncer Kılınç ile eski Özel Harekat Daire Başkanvekili İbrahim Şahin'in de aralarında bulunduğu, biri kadın 13 kişi gözaltına alındı. İbrahim Şahin'in evinde ele geçirilen cephanelik krokileri ile suikast listesi gündeme bomba gibi düştü.
11 Dalga: 16 ilde yaklaşık 40 kişi gözaltında. Gözaltına alınanlar arasında Türk Metal Sendikası eski Genel Başkanı Mustafa Özbek, Elazığ Özel Harekat Şube Müdürü de bulunuyordu.
Ayrıca, bir yüzbaşı, üç teğmen, dört astsubay, bir emniyet müdürü ve sekiz polis gözaltına alındı. Operasyonda gözaltına alınanlardan Özbek'in yanı sıra 7'si askeri personel, 10'u polis olmak üzere 18 kişi tutuklandı.
